2020年9月8日,我校作物遺傳改良國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院蛋白質(zhì)科學(xué)研究團(tuán)隊(duì)與清華大學(xué)閆創(chuàng)業(yè)研究員合作在Cell Research雜志在線發(fā)表題為“Cryo-EM structure of the human mitochondrial translocase TIM22 complex”的研究論文,在國(guó)際上首次報(bào)道了線粒體內(nèi)膜轉(zhuǎn)位酶TIM22復(fù)合物的高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu)。
線粒體在細(xì)胞生命活動(dòng)中執(zhí)行至關(guān)重要的作用,包括能量代謝、細(xì)胞程序性死亡、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、氨基酸生物合成、蛋白質(zhì)質(zhì)量控制和降解等。人類(lèi)線粒體含有約1500種蛋白。在線粒體進(jìn)化過(guò)程中,其遺傳系統(tǒng)經(jīng)過(guò)重排,大多數(shù)線粒體的自身基因被轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核或者丟失。因此,線粒體中99%的蛋白需要在細(xì)胞質(zhì)中核糖體上合成并精確的轉(zhuǎn)運(yùn)到特定的線粒體亞結(jié)構(gòu)區(qū)域,才能發(fā)揮其功能。線粒體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)由線粒體蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)負(fù)責(zé),該系統(tǒng)主要含有六種蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合物:線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶(TOM)、線粒體內(nèi)膜前導(dǎo)序列轉(zhuǎn)位酶(TIM23)、線粒體內(nèi)膜載體蛋白轉(zhuǎn)位酶(TIM22)、線粒體外膜分選和裝配機(jī)器(SAM)、線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)復(fù)合物(MIM)和線粒體膜間隙轉(zhuǎn)運(yùn)與裝配機(jī)器(MIA)。線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)缺陷或功能紊亂,會(huì)導(dǎo)致多種復(fù)雜的人類(lèi)疾病,例如癌癥、神經(jīng)退行性疾病和肌肉組織相關(guān)疾病。
載體蛋白是一類(lèi)定位于線粒體內(nèi)膜,含有六次跨膜螺旋的膜蛋白;它通過(guò)促進(jìn)特定的底物擴(kuò)散通過(guò)線粒體內(nèi)膜或者利用膜電勢(shì)轉(zhuǎn)運(yùn)代謝物質(zhì),來(lái)完成代謝物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)入或者轉(zhuǎn)出線粒體基質(zhì)。載體蛋白生物發(fā)生由TOM和TIM22復(fù)合物完成。TIM22復(fù)合物負(fù)責(zé)載體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)和插入到線粒體內(nèi)膜。人源TIM22復(fù)合物包含至少6個(gè)組分:Tim22、Tim29、Tim9、Tim10a、Tim10b and AGK。盡管在TIM22復(fù)合物的功能和疾病發(fā)生研究中取得了很大進(jìn)展,但是TIM22復(fù)合物的結(jié)構(gòu)特征和載體蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制依然不清楚。
在該研究中,我校蛋白質(zhì)科學(xué)研究團(tuán)隊(duì)成功將TIM22復(fù)合物6個(gè)亞基在哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)體系中共表達(dá),通過(guò)冷凍電鏡的方法進(jìn)行數(shù)據(jù)收集和處理,解析了TIM22復(fù)合物的近原子分辨率結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明,在TIM22復(fù)合物結(jié)構(gòu)中,含有1分子Tim22、Tim29、AGK蛋白;含有2個(gè)分子伴侶六聚體復(fù)合物Tim9/10a(3:3)和Tim9/10a/10b(2:3:1)(圖1)。Tim29是一個(gè)單次跨膜蛋白,通過(guò)其N端螺旋來(lái)穩(wěn)定Tim22蛋白結(jié)構(gòu);同時(shí)通過(guò)其C端膜間隙結(jié)構(gòu)域與AGK和2個(gè)分子伴侶六聚體復(fù)合物相互作用來(lái)維持TIM22復(fù)合物的完整性(圖1)。Tim9/10a復(fù)合物接受通過(guò)線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶TOM復(fù)合物通道的載體蛋白前體,并傳遞給Tim9/10a/10b復(fù)合物,最后呈遞給Tim22蛋白。Tim22蛋白包含4個(gè)跨膜螺旋,形成一個(gè)開(kāi)口朝向脂雙層的空腔,推測(cè)該空腔參與載體蛋白的插膜和橫向分選到線粒體內(nèi)膜過(guò)程。該研究揭示了TIM22復(fù)合物的自身裝配和詳細(xì)的結(jié)構(gòu)信息,為進(jìn)一步理解和研究載體蛋白通過(guò)TIM22復(fù)合物插入到線粒體內(nèi)膜的分子機(jī)制提供結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。同時(shí)也為線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)相關(guān)疾病提供潛在的藥物靶點(diǎn)。
我校生科院博士生漆良波、王強(qiáng)和官澤源為該論文共同第一作者。殷平教授和閆創(chuàng)業(yè)研究員為共同通訊作者。前期冷凍樣品制備和樣品篩選主要在華中農(nóng)業(yè)大學(xué)電鏡平臺(tái)完成。冷凍電鏡數(shù)據(jù)收集在浙江大學(xué)冷凍電鏡中心完成。該研究受到了科技部基金、國(guó)家自然科學(xué)基金、校自主創(chuàng)新基金的資助。
文章鏈接:http://www.nature.com/articles/s41422-020-00400-w
圖1 線粒體內(nèi)膜轉(zhuǎn)位酶TIM22復(fù)合物冷凍電鏡結(jié)構(gòu)
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