南湖網(wǎng)訊(通訊員卓重 涵旗)在基因組中,有一種到處亂跑的“搗蛋鬼”DNA序列,可以從基因組的一個(gè)位置“跳躍”到另一個(gè)位置,被稱(chēng)為“轉(zhuǎn)座子”。曾被認(rèn)為是“垃圾DNA”的轉(zhuǎn)座子,近年來(lái)被發(fā)現(xiàn)其實(shí)是基因組的巧妙設(shè)計(jì)。近日,我校水稻團(tuán)隊(duì)熊立仲課題組研究表明,水稻中的一類(lèi)DNA轉(zhuǎn)座子能抑制內(nèi)源蛋白Ghd2的翻譯,從而調(diào)控水稻開(kāi)花時(shí)間、株高和每穗粒數(shù),具有顯著的生物學(xué)功能。
3月3日,相關(guān)研究成果以“Translational repression by a miniature inverted-repeat transposable element in the 3′ untranslated region”在《Nature Communications》上在線發(fā)表。生科院沈建強(qiáng)博士生為論文的第一作者,熊立仲教授為通訊作者。
水稻作為全世界最重要的糧食作物和模式植物之一,其基因組中含有大量的轉(zhuǎn)座子,尤其是微小反向重復(fù)轉(zhuǎn)座元件(MITE),這使水稻成為研究轉(zhuǎn)座子起源、轉(zhuǎn)座和功能的最佳模式植物之一。曾被認(rèn)為是“垃圾DNA”的轉(zhuǎn)座子是真核生物基因組中重要的組成成分,在基因組進(jìn)化過(guò)程中發(fā)揮著巨大作用。轉(zhuǎn)座子一般可分為反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子和DNA轉(zhuǎn)座子。之前的研究顯示,反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子可以轉(zhuǎn)錄為mRNA一部分,調(diào)控mRNA的選擇性剪接,選擇性加尾,穩(wěn)定和翻譯。本研究表明,DNA轉(zhuǎn)座子能抑制內(nèi)源蛋白Ghd2的翻譯,從而調(diào)控水稻開(kāi)花時(shí)間、株高和每穗粒數(shù)。這個(gè)發(fā)現(xiàn)對(duì)進(jìn)一步了解MITE的生物學(xué)功能具有重要意義。
該研究發(fā)現(xiàn)存在于基因3′非翻譯區(qū)中的微小反向重復(fù)轉(zhuǎn)座元件(MITE)可以被植物內(nèi)源DCL蛋白識(shí)別并切割,從而形成不完整的mRNA。這種mRNA可能會(huì)進(jìn)一步影響自身的翻譯,而抑制翻譯產(chǎn)物的積累。人為切除該基因非翻譯區(qū)的MITE,則會(huì)上調(diào)此基因的翻譯產(chǎn)物。這些結(jié)果證實(shí),DNA轉(zhuǎn)座子具有抑制mRNA翻譯的功能。
基因組中重復(fù)序列的功能探究,一直是生命科學(xué)中最前沿的領(lǐng)域之一。近來(lái),越來(lái)越多的功能基因組研究發(fā)現(xiàn),微小反向重復(fù)轉(zhuǎn)座元件(MITE)在基因組中的插入或缺失,是單子葉植物獲得新性狀的來(lái)源。本研究揭示了微小反向重復(fù)轉(zhuǎn)座元件的新功能,對(duì)研究其他重復(fù)序列的功能提供了借鑒意義,同時(shí)也拓寬了學(xué)界對(duì)于轉(zhuǎn)座子的認(rèn)識(shí)。
審核人:沈建強(qiáng)