我院合成生物學課題組碩士研究生宋文江同學在其導師Mario Andrea Marchisio副教授的指導下,在《Journal of Biological Engineering》(IF: 3.0)上發(fā)表了題為“Can terminators be used as insulators into yeast synthetic gene circuits?”的研究論文,該論文通訊作者為我院外籍教師Mario Andrea Marchisio,哈工大生命學院為唯一通訊單位。
在細菌中,轉(zhuǎn)錄單元可以通過在其啟動子上游插入終止子而被絕緣。以這種方式,啟動子泄露量由于其來自上游基因的通讀或RNA聚合酶與DNA的非特異性結(jié)合而被移除。與細菌終止子不同的是,釀酒酵母的終止子包含一個六聚體序列,該效能部分與真核細胞的TATA盒(能夠被RNA聚合酶II識別并結(jié)合的啟動子序列)極為相似。
該課題組通過將不同的酵母終止子(自然的和合成的)插入到去除了上游活化序列和TATA盒的CYC1酵母基本啟動子的上游,已經(jīng)證實該效能部分能夠結(jié)合RNA聚合酶II并發(fā)揮TATA盒的功能。此外,將終止子放置到強或中強度的酵母基本啟動子上游能夠顯著降低該啟動子的轉(zhuǎn)錄活性。
研究數(shù)據(jù)表明,RNA聚合酶II分子可以通過和絕緣子效能部分結(jié)合從而與啟動子增強子的活化蛋白或其他RNA聚合酶II分子結(jié)合TATA盒進行競爭,最終干擾蛋白的表達。因此,在釀酒酵母中構(gòu)建合成基因環(huán)路時應該盡量避免非弱啟動子的絕緣。
文章鏈接:https://jbioleng.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13036-016-0040-5
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