我院生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室2014級(jí)碩士研究生韓智杰同學(xué)在其導(dǎo)師蔣慶華副教授的指導(dǎo)下,完成論文《Analyzinglarge-scale samples confirms the association between the rs1051730 polymorphismand lung cancer susceptibility》,并于近期發(fā)表在《Scientific Reports》(IF=5.578)。
自從2005年,Klein等首次將全基因組關(guān)聯(lián)性分析 (Genome-wide association study,GWAS)用于視網(wǎng)膜黃斑病變的研究之后,GWAS以其對(duì)探究復(fù)雜疾病發(fā)病機(jī)理的強(qiáng)大功能一直被發(fā)展至今。GWAS能夠在全基因組的范圍內(nèi)找到與某種疾病相關(guān)的SNP位點(diǎn)。但是,對(duì)于同一種疾病往往有很多個(gè)GWAS 研究在不同的人群中進(jìn)行。由于實(shí)驗(yàn)人群的不同、基因分型的誤差和分析方法的差異等原因,使得這些研究的結(jié)果往往不盡相同。針對(duì)這一問(wèn)題meta分析通過(guò)綜合并過(guò)濾這些大量的GWAS研究的數(shù)據(jù),以及對(duì)其人群異質(zhì)性和發(fā)表偏倚性的分析,使GWAS 研究的結(jié)論更加客觀真實(shí)。本文收集了現(xiàn)有的rs1051730 SNP位點(diǎn)的GWAS研究數(shù)據(jù),用meta分析的方法評(píng)估了其與肺癌發(fā)生的相關(guān)性及其在不同人種中的差異,對(duì)進(jìn)一步理解肺癌的遺傳機(jī)理提供了依據(jù)。
文章鏈接:http://www.nature.com/articles/srep15642
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