12月2日下午,經(jīng)過整整一個星期的緊張工作,我校計算機藥物輔助設(shè)計系統(tǒng)在藥學(xué)院正式通過驗收,投入運行。從此,我校的藥物創(chuàng)新又增加了新的技術(shù)平臺;新藥分子設(shè)計與藥物研究開發(fā)(Molecular Design and Drug Discovery & Development)在技術(shù)支持上又上了一個新臺階。該系統(tǒng)同時還可以為藥物發(fā)現(xiàn)的相關(guān)學(xué)科如結(jié)構(gòu)生物學(xué)(Structural Biology)等提供有力支持。
據(jù)有關(guān)負責(zé)人介紹,我校計算機藥物輔助設(shè)計系統(tǒng)在軟件方面配備了包括主要兩大軟件公司(Accelrys和MDL)的30多個有關(guān)軟件模塊。目前,三個終端可以同時使用;明年視需要可升至七個終端。其中,在分子設(shè)計方面,該系統(tǒng)擁Catalyst, Cerius2 和 Discovery Studio等大型的軟件;可以用來從事DNA,RNA或蛋白質(zhì)等的三維模型建立研究;也可以用來開展結(jié)合點的自動尋找、分子對接、全新設(shè)計、虛擬篩選、活性預(yù)測、一維或多維構(gòu)效關(guān)系等等方面的探索研究。同時,該系統(tǒng)還擁有藥物安全預(yù)測軟件。此外,我校計算機藥物輔助設(shè)計系統(tǒng)同時配備了多個大型經(jīng)驗數(shù)據(jù)庫及分子碎片數(shù)據(jù)庫及相關(guān)建庫軟件。
在硬件配備方面,我校計算機藥物輔助設(shè)計系統(tǒng)安裝了立體顯示系統(tǒng)。這使得藥物分子與生物大分子之間的相互作用以十分生動,近似可觸摸的方式呈現(xiàn)在設(shè)計者的眼前。這對精確藥物設(shè)計(Precise Drug Design)提供了方便。
據(jù)介紹, 我校計算機藥物輔助設(shè)計系統(tǒng)無論是在設(shè)計軟件配備規(guī)模方面還是所擁有數(shù)據(jù)庫方面,在國內(nèi)高校同類實驗室里,屬于‘相當(dāng)龐大與完整’的。在硬件方面,我校的立體顯示系統(tǒng)則尤為突出。據(jù)有關(guān)代理商提供的信息及筆者所知,在國內(nèi),目前只有上海藥物研究所等少數(shù)單位安裝了立體顯示系統(tǒng)。
據(jù)有關(guān)負責(zé)人介紹,我校計算機藥物輔助設(shè)計系統(tǒng)基本上實現(xiàn)了當(dāng)初的總體設(shè)想,在嫻熟各種藥物分子設(shè)計軟件的基礎(chǔ)上,花最少的錢,精心挑選與配置,以可行的方式以確保所建立起來的系統(tǒng)能達到‘今天先進,3-5年內(nèi)不落后’的目標(biāo)。
在計算機藥物輔助設(shè)計系統(tǒng)的軟硬件挑選,以及采購安裝整個過程中,始終得到了學(xué)校、藥學(xué)院、資產(chǎn)管理處、人事處等部門領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)懷和支持。
軟件系統(tǒng)的最大價值在于使用。歡迎我校師生及所有對此感興趣的人員前來使用、參觀和指導(dǎo)!詳細情況請與藥學(xué)院聯(lián)系:
聯(lián)系人:馬大友
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