DNA四種堿基中的鳥嘌呤(G)堿基氧化還原性質(zhì)最為活潑,OH•是生物體內(nèi)反應(yīng)活性最強(qiáng)的活性氧自由基,OH•與G堿基的反應(yīng)在DNA氧化損傷等過程中扮演重要的角色。然而, OH•與G堿基的反應(yīng)機(jī)理仍然存在爭(zhēng)議:普遍接受的加成-脫水機(jī)制及最近提出的奪氫-異構(gòu)化機(jī)制。解決爭(zhēng)議的關(guān)鍵是區(qū)分反應(yīng)過程中涉及的G自由基中間體(亞氨基dG(N1-H)•自由及氨基dG(N2-H)•自由基)并確定其反應(yīng)特性。
圖A: OH•與G堿基反應(yīng)生成dG(N1-H)•自由基的兩種反應(yīng)機(jī)制;圖B:光誘導(dǎo)前體1生成dG(N2-H)•及自由基的anti-和syn-兩種構(gòu)像; 圖C: 激光光解典型時(shí)刻的瞬態(tài)紫外-可見吸收光譜; 圖D: 吸收峰分別在610 nm和650 nm的高斯線型擬合anti-和syn-構(gòu)像的dG(N2-H)•瞬態(tài)吸收光譜。
最近,蘇紅梅老師課題組與美國(guó)約翰·霍普金斯大學(xué)Marc M. Greenberg教授課題組合作,由設(shè)計(jì)合成的核苷酸衍生物前體1和苯乙酮光敏反應(yīng)制備出純凈的dG(N2-H)•自由基,通過時(shí)間分辨光譜實(shí)時(shí)探測(cè)自由基的反應(yīng)過程。在瞬態(tài)紫外-可見光譜上觀測(cè)到位于610 nm和650 nm的兩個(gè)特征吸收峰,結(jié)合理論計(jì)算分別歸屬為anti-dG(N2-H)• (610 nm)和syn-dG(N2-H)• (650 nm)兩種構(gòu)像。同時(shí),動(dòng)力學(xué)分析表明伴隨dG(N2-H)•特征吸收峰610 nm和650 nm在幾百μs時(shí)間尺度上的衰減,dG(N1-H)•相對(duì)于dG(N2-H)•具有較大消光系數(shù)的370 nm處的信號(hào)卻只有衰減,說明dG(N2-H)•的衰減并沒有對(duì)應(yīng)dG(N1-H)•的生成,排除了dG(N2-H)•在幾百μs時(shí)間范圍內(nèi)異構(gòu)化生成dG(N1-H)•的可能。研究結(jié)果為排除奪氫-異構(gòu)化機(jī)制提供了關(guān)鍵的實(shí)驗(yàn)證據(jù),并且首次在瞬態(tài)光譜上區(qū)分了dG(N2-H)•自由基的anti-和syn-兩種構(gòu)像,研究揭示了OH•與G堿基等DNA氧化損傷反應(yīng)中的G自由基中間體的光譜特征和動(dòng)力學(xué)反應(yīng)機(jī)制。該研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金委重點(diǎn)基金、杰出青年科學(xué)基金、和北京師范大學(xué)人才引進(jìn)專項(xiàng)等項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)的大力資助,論文近期發(fā)表在《Angewandte Chemie International Edition》(Independent Generation and Time-Resolved Detection of 2'-Deoxyguanosin-N2-yl Radical, Angew. Chem. Int. Ed. 10.1002/anie.202005300)
原文鏈接:https://doi.org/10.1002/anie.202005300
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