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藥學(xué)院天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室劉濤研究團(tuán)隊(duì)與美國(guó)Scripps研究所Peter G. Schultz研究團(tuán)隊(duì)開展合作,聯(lián)合建立了包含近千種藥用蛋白的分泌蛋白庫(kù),并基于該庫(kù)創(chuàng)建了反轉(zhuǎn)錄病毒介導(dǎo)的單細(xì)胞篩選方法,對(duì)發(fā)現(xiàn)具有全新藥用價(jià)值的蛋白和新的抗體藥物的治療靶點(diǎn)具有重大意義。該研究成果于2017年6月8日在Cell子刊Cell Chemical Biology發(fā)表。
人類基因組中有超過(guò)2000個(gè)基因編碼分泌蛋白,約占整個(gè)基因組的10%,其中富含調(diào)控生命活動(dòng)的具有重大藥用價(jià)值的蛋白,包括激素、細(xì)胞因子、生長(zhǎng)因子、趨化因子和蛋白酶等。然而目前大多數(shù)分泌蛋白的功能尚不清楚,同時(shí)缺乏有效的專門針對(duì)分泌蛋白的篩選方法,嚴(yán)重制約了新的藥用蛋白和藥物靶點(diǎn)蛋白的發(fā)現(xiàn)。
劉濤研究團(tuán)隊(duì)利用反轉(zhuǎn)錄病毒,通過(guò)一個(gè)細(xì)胞一個(gè)基因(OGOC, one gene one cell)的感染技術(shù),利用分泌蛋白在細(xì)胞膜外定位的特點(diǎn),實(shí)現(xiàn)了分泌蛋白基因庫(kù)的富集?;蛏疃葴y(cè)序(NGS)結(jié)果表明,共有3699個(gè)基因被富集出來(lái),其中已知的分泌型蛋白基因的讀長(zhǎng)頻率占了77.77%。該團(tuán)隊(duì)還建立了單細(xì)胞水平的自分泌篩選系統(tǒng),這種基于反轉(zhuǎn)錄病毒的高通量新型篩選系統(tǒng)避免了蛋白的表達(dá)純化,和基于96孔板的傳統(tǒng)篩選方式相比,省時(shí)省力,為篩選在生命調(diào)控過(guò)程中具有重大生物學(xué)意義以及藥用價(jià)值的蛋白奠定了基礎(chǔ)。
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該研究成果發(fā)表在Cell Chemical Biology雜志上。劉濤研究員為第一作者兼主要責(zé)任通訊作者(Lead Contact),北京大學(xué)藥學(xué)院天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室為第一責(zé)任通訊單位,美國(guó)Scripps研究所Peter G. Schultz教授為共同通訊作者,美國(guó)Johns Hopkins大學(xué)的H. Benjamin Larman教授研究團(tuán)隊(duì)為合作單位。團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人劉濤研究員完成了該蛋白庫(kù)的建立并設(shè)計(jì)了篩選方法,劉濤研究團(tuán)隊(duì)的研究生賈盼盼完成了該基因庫(kù)的深度測(cè)序分析,團(tuán)隊(duì)的博士后馬懷雷建立了單細(xì)胞的自分泌篩選方法。該工作獲得了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(No. 2016YFA0201400)、北京大學(xué)百人計(jì)劃以及美國(guó)加州生物醫(yī)學(xué)研究所的資助。
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?劉濤研究員(左一),研究生賈盼盼(左二),馬懷雷博士(右一)。
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論文鏈接:http://www.cell.com/cell-chemical-biology/fulltext/S2451-9456(17)30180-0
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劉濤研究員,生于1982年。博士,博士生導(dǎo)師,天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室獨(dú)立PI,北京大學(xué)藥學(xué)院特聘研究員。北京大學(xué)百人計(jì)劃。發(fā)表科研論文20篇,其中以第一作者或者通訊作者的身份在Cell Chem Biol, PNAS, J Am Chem Soc, Angew Chem, J Med Chem, ACS ChemBiol, 等一系列雜志上發(fā)表高水平論文13篇,申請(qǐng)國(guó)際專利三項(xiàng)。自2010年至今擔(dān)任Faculty of 1000 (F1000)的教職成員,作為化學(xué)生物學(xué)部的點(diǎn)評(píng)專家,撰寫評(píng)論10余篇。全英文教學(xué)講授北京大學(xué)研究生課程《現(xiàn)代生物藥物研究與開發(fā)》等。團(tuán)隊(duì)研究方向以蛋白大分子生物工程,化學(xué)修飾以及細(xì)胞的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究為主。研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用化學(xué)生物學(xué),合成生物學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的研究方法,以遺傳密碼子擴(kuò)展技術(shù)和分子文庫(kù)篩選技術(shù)為核心,突破大自然中蛋白質(zhì)是由20種天然氨基酸所組成的局限,并將其應(yīng)用到蛋白大分子制藥和闡明疾病的發(fā)生發(fā)展機(jī)理領(lǐng)域,為生物藥物的升級(jí)換代和開發(fā)新的治療靶點(diǎn)奠定基礎(chǔ)。
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天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室? 宋書香? 供稿
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藥學(xué)院天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室劉濤研究團(tuán)隊(duì)與美國(guó)Scripps研究所Peter G. Schultz研究團(tuán)隊(duì)開展合作,聯(lián)合建立了包含近千種藥用蛋白的分泌蛋白庫(kù),并基于該庫(kù)創(chuàng)建了反轉(zhuǎn)錄病毒介導(dǎo)的單細(xì)胞篩選方法,對(duì)發(fā)現(xiàn)具有全新藥用價(jià)值的蛋白和新的抗體藥物的治療靶點(diǎn)具有重大意義。該研究成果于2017年6月8日在Cell子刊Cell Chemical Biology發(fā)表。
人類基因組中有超過(guò)2000個(gè)基因編碼分泌蛋白,約占整個(gè)基因組的10%,其中富含調(diào)控生命活動(dòng)的具有重大藥用價(jià)值的蛋白,包括激素、細(xì)胞因子、生長(zhǎng)因子、趨化因子和蛋白酶等。然而目前大多數(shù)分泌蛋白的功能尚不清楚,同時(shí)缺乏有效的專門針對(duì)分泌蛋白的篩選方法,嚴(yán)重制約了新的藥用蛋白和藥物靶點(diǎn)蛋白的發(fā)現(xiàn)。
劉濤研究團(tuán)隊(duì)利用反轉(zhuǎn)錄病毒,通過(guò)一個(gè)細(xì)胞一個(gè)基因(OGOC, one gene one cell)的感染技術(shù),利用分泌蛋白在細(xì)胞膜外定位的特點(diǎn),實(shí)現(xiàn)了分泌蛋白基因庫(kù)的富集?;蛏疃葴y(cè)序(NGS)結(jié)果表明,共有3699個(gè)基因被富集出來(lái),其中已知的分泌型蛋白基因的讀長(zhǎng)頻率占了77.77%。該團(tuán)隊(duì)還建立了單細(xì)胞水平的自分泌篩選系統(tǒng),這種基于反轉(zhuǎn)錄病毒的高通量新型篩選系統(tǒng)避免了蛋白的表達(dá)純化,和基于96孔板的傳統(tǒng)篩選方式相比,省時(shí)省力,為篩選在生命調(diào)控過(guò)程中具有重大生物學(xué)意義以及藥用價(jià)值的蛋白奠定了基礎(chǔ)。
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該研究成果發(fā)表在Cell Chemical Biology雜志上。劉濤研究員為第一作者兼主要責(zé)任通訊作者(Lead Contact),北京大學(xué)藥學(xué)院天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室為第一責(zé)任通訊單位,美國(guó)Scripps研究所Peter G. Schultz教授為共同通訊作者,美國(guó)Johns Hopkins大學(xué)的H. Benjamin Larman教授研究團(tuán)隊(duì)為合作單位。團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人劉濤研究員完成了該蛋白庫(kù)的建立并設(shè)計(jì)了篩選方法,劉濤研究團(tuán)隊(duì)的研究生賈盼盼完成了該基因庫(kù)的深度測(cè)序分析,團(tuán)隊(duì)的博士后馬懷雷建立了單細(xì)胞的自分泌篩選方法。該工作獲得了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(No. 2016YFA0201400)、北京大學(xué)百人計(jì)劃以及美國(guó)加州生物醫(yī)學(xué)研究所的資助。
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?劉濤研究員(左一),研究生賈盼盼(左二),馬懷雷博士(右一)。
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論文鏈接:http://www.cell.com/cell-chemical-biology/fulltext/S2451-9456(17)30180-0
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劉濤研究員,生于1982年。博士,博士生導(dǎo)師,天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室獨(dú)立PI,北京大學(xué)藥學(xué)院特聘研究員。北京大學(xué)百人計(jì)劃。發(fā)表科研論文20篇,其中以第一作者或者通訊作者的身份在Cell Chem Biol, PNAS, J Am Chem Soc, Angew Chem, J Med Chem, ACS ChemBiol, 等一系列雜志上發(fā)表高水平論文13篇,申請(qǐng)國(guó)際專利三項(xiàng)。自2010年至今擔(dān)任Faculty of 1000 (F1000)的教職成員,作為化學(xué)生物學(xué)部的點(diǎn)評(píng)專家,撰寫評(píng)論10余篇。全英文教學(xué)講授北京大學(xué)研究生課程《現(xiàn)代生物藥物研究與開發(fā)》等。團(tuán)隊(duì)研究方向以蛋白大分子生物工程,化學(xué)修飾以及細(xì)胞的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究為主。研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用化學(xué)生物學(xué),合成生物學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的研究方法,以遺傳密碼子擴(kuò)展技術(shù)和分子文庫(kù)篩選技術(shù)為核心,突破大自然中蛋白質(zhì)是由20種天然氨基酸所組成的局限,并將其應(yīng)用到蛋白大分子制藥和闡明疾病的發(fā)生發(fā)展機(jī)理領(lǐng)域,為生物藥物的升級(jí)換代和開發(fā)新的治療靶點(diǎn)奠定基礎(chǔ)。
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天然藥物及仿生藥物國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室? 宋書香? 供稿
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