生命學(xué)院張竹青課題組發(fā)布首個(gè)蛋白質(zhì)體外液液相分離數(shù)據(jù)庫
近年來，蛋白質(zhì)液液相分離（Liquid-liquid Phase Separation, LLPS）逐漸成為生物學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。它在生命體的正常代謝和疾病過程中都發(fā)揮著非常重要的作用。隨著越來越多的探索LLPS具體發(fā)生機(jī)制的報(bào)道，人們發(fā)現(xiàn)影響蛋白質(zhì)LLPS的因素主要來自于兩個(gè)方面：一是蛋白質(zhì)序列性質(zhì)，如突變及翻譯后修飾的影響；二是受到體系微環(huán)境，比如溫度、蛋白質(zhì)濃度、pH值、鹽濃度、壓力等的調(diào)節(jié)。生命學(xué)院張竹青課題組收集了目前文獻(xiàn)報(bào)道過的所有能在體外發(fā)生LLPS的蛋白質(zhì)及其相分離相關(guān)實(shí)驗(yàn)條件，經(jīng)過系統(tǒng)的分類整理和注釋，發(fā)布了目前首個(gè)專門研究蛋白質(zhì)體外LLPS的數(shù)據(jù)庫（Liquid-liquid phase separation database, LLPSDB）。通過網(wǎng)站(http://bio-comp.ucas.ac.cn/llpsdb or http://bio-comp.org.cn/llpsdb)，用戶可以對數(shù)據(jù)庫進(jìn)行瀏覽、查詢和下載。文章“LLPSDB: a database of proteins undergoing liquid–liquid phase separation in vitro”于2019年9月6日在國際著名期刊Nucleic Acids Research（IF=11.147）上在線發(fā)表（https://doi.org/10.1093/nar/gkz778）。生命學(xué)院碩士生李倩和彭小珺為論文共同第一作者，2016級本科生李源清、唐文勤和朱家安參與了部分工作，張竹青副教授為論文通訊作者。該研究得到了國家自然科學(xué)基金和中國科學(xué)院大學(xué)青年教師提升項(xiàng)目的支持。
LLPSDB的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
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