何春江團(tuán)隊(duì)解析年齡相關(guān)的免疫和基因表達(dá)變化
近日，Briefings in Bioinformatics 在線發(fā)表了華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生物醫(yī)學(xué)與健康學(xué)院何春江教授課題組研究論文，題目為“ADEIP: an integrated platform of age-dependent expression and immune profiles across human tissues”。該研究搭建了一個(gè)平臺(tái)ADEIP，用于展示和檢索年齡相關(guān)的基因表達(dá)和免疫圖譜。
圖1. ADEIP的界面和開(kāi)發(fā)流程
ADEIP包括來(lái)自GTEx計(jì)劃中30個(gè)主要人體組織超過(guò)16000個(gè)樣本的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，這些樣本來(lái)的年齡范圍在20-80歲之間的捐贈(zèng)者。該研究對(duì)不同年齡組的差異表達(dá)基因和基因集、免疫相關(guān)基因和免疫細(xì)胞組成等幾個(gè)方面進(jìn)行了整合分析。同時(shí)對(duì)已知與SARS-CoV-2和人類間充質(zhì)干細(xì)胞(hMSC)相關(guān)的基因進(jìn)行了舉例分析，展示了ADEIP的相關(guān)應(yīng)用。作為一個(gè)比較全面的平臺(tái)，ADEIP可用于研究與衰老相關(guān)的表達(dá)和跨組織的免疫地圖，有助于了解與年齡相關(guān)的傳染病或遺傳疾病的機(jī)制，從而開(kāi)發(fā)個(gè)性化的治療方案。
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院研究生劉旋和武漢大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院陳文博為該論文共同第一作者，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生物醫(yī)學(xué)與健康學(xué)院何春江教授、德州農(nóng)工大學(xué)韓冷教授和華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生物醫(yī)學(xué)與健康學(xué)院董志強(qiáng)教授為共同通訊作者，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院章文教授參與研究。
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https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbab274/6319933
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