2021年8月20日,清華大學(xué)藥學(xué)院饒燏團(tuán)隊(duì)在《Cell?Research》雜志上發(fā)表了題為“Merging PROTAC and molecular glue for degrading BTK and GSPT1 proteins concurrently”的研究論文,該工作報(bào)道了一類新型的雙機(jī)制降解劑,該降解劑既能夠以PROTAC方式靶向BTK,同時(shí)也以分子膠的方式降解GSPT1,與單靶降解劑或抑制劑相比,這種雙機(jī)制降解劑實(shí)現(xiàn)了更高效的DLBCL和AML腫瘤細(xì)胞增殖抑制效果,為DLBCL和AML治療提供新型治療方案。

靶向蛋白降解是以泛素-蛋白酶體系統(tǒng)為基礎(chǔ),用小分子降解劑誘導(dǎo)靶蛋白降解的一種技術(shù),其中最主要的兩種降解機(jī)制包括PROTAC和分子膠。PROTAC分子由三部分組成,此種組裝方式形成的嵌合體可將靶蛋白錨定到E3泛素連接酶進(jìn)而誘導(dǎo)其泛素化降解。與PROTAC類似,分子膠是單一的小分子片段,分子量較小,它通過(guò)誘導(dǎo)靶蛋白與E3泛素連接酶之間形成較為緊密的蛋白-蛋白相互作用來(lái)實(shí)現(xiàn)泛素化降解。?
近幾年兩種蛋白降解技術(shù)發(fā)展迅速,但也顯露出各自的優(yōu)缺點(diǎn),例如PROTAC適于理性設(shè)計(jì),但由于分子量偏大,導(dǎo)致成藥性不足。分子膠分子量小,成藥性好,且能降解難成藥靶點(diǎn),可以彌補(bǔ)PROTAC的不足,但由于需要在兩個(gè)蛋白之間誘導(dǎo)形成一個(gè)結(jié)合口袋,設(shè)計(jì)上具有非常大的難度。而如何平衡二者的優(yōu)劣之處使靶向降解技術(shù)得到進(jìn)一步發(fā)展是一個(gè)非常值得思考的問(wèn)題,為打破現(xiàn)有技術(shù)的桎梏,作者在此工作中首次提出了將PROTAC分子與分子膠相融合的概念,為靶向蛋白降解開(kāi)拓了一條新的道路。

作者在之前的工作中實(shí)現(xiàn)了BTK野生型和突變型蛋白的高效降解,解決了臨床耐藥問(wèn)題,但另一挑戰(zhàn)出現(xiàn)了,目前不論是BTK抑制劑還是PROTAC分子,對(duì)難治性的DLBCL及AML很難達(dá)到較好的治療效果,而為了突破這一難題,作者想到可利用另一靶點(diǎn)的同時(shí)降解來(lái)實(shí)現(xiàn),GSPT1是翻譯終止因子,協(xié)調(diào)完成體內(nèi)蛋白的翻譯過(guò)程,而GSPT1的下調(diào)可使蛋白表達(dá)異常,進(jìn)而抑制多種腫瘤細(xì)胞的增殖和生存。因此作者希望利用雙機(jī)制降解劑將GSPT1的降解引入到靶向BTK的PROTAC分子中,進(jìn)而打破靶向BTK分子在淋巴瘤應(yīng)用中的壁壘。
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如何將PROTAC與molecular glue兩種降解機(jī)制相融合是這篇工作中作者要解決的核心技術(shù)問(wèn)題。因此基于此前開(kāi)發(fā)的靶向BTK的PROTACs及已有針對(duì)GSPT1的分子膠的研究,作者開(kāi)發(fā)了一系列雙靶雙機(jī)制降解劑并證明了這類降解劑分別以PROTAC和分子膠的方式降解BTK和GSPT1,首次實(shí)現(xiàn)了PROTAC和分子膠的理性結(jié)合和設(shè)計(jì)。并且與單靶抑制劑ibrutinib或降解劑L18I相比,作者所提出的雙機(jī)制降解劑在多種DLBCL及AML細(xì)胞上均具有更高效的增殖抑制活性,為臨床治療提供了新的方案,這也是該工作開(kāi)發(fā)新型降解劑的應(yīng)用價(jià)值所在。

綜上,作者根據(jù)PROTAC和分子膠的特點(diǎn)首次設(shè)計(jì)合成了一系列雙靶、雙機(jī)制的降解劑,這類新型降解劑既保留了降解BTK的PROTAC活性,又兼具降解GSPT1的分子膠特點(diǎn),以PROTAC的思路設(shè)計(jì)合成雙機(jī)制降解劑解決了分子膠設(shè)計(jì)難度高的問(wèn)題,而作為分子膠降解GSPT1也補(bǔ)充了PROTAC在生物活性上的不足,對(duì)難治性腫瘤的臨床治療具有重要意義。因此,作者所致力于的雙機(jī)制降解劑開(kāi)發(fā)為靶向降解技術(shù)的發(fā)展打開(kāi)了新的大門。
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饒燏團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期從事蛋白質(zhì)靶向降解技術(shù)的開(kāi)發(fā)工作,致力于發(fā)展新型降解技術(shù)及其應(yīng)用,已取得了系列研究成果:實(shí)現(xiàn)難成藥靶點(diǎn)的藥物開(kāi)發(fā),設(shè)計(jì)合成全球首例選擇性CDK2降解劑,實(shí)現(xiàn)AML高效且低毒的分化治療(Nature Chemical Biology 2021);構(gòu)建高效的BTK降解劑,解決臨床中出現(xiàn)的Ibrutinib耐藥問(wèn)題(Cell Research 2018;Leukemia 2019);構(gòu)建PROTACs系統(tǒng)性敲除模型,快速可逆實(shí)現(xiàn)動(dòng)物體內(nèi)蛋白敲除(Cell Discovery 2019);構(gòu)建PARP1降解劑(Chemical Communications 2019);構(gòu)建新型CDK4/6降解劑,有效抑制腫瘤增殖(Journal of Medicinal Chemistry 2019);構(gòu)建HDAC6降解劑,實(shí)現(xiàn)普適性的HDAC6的選擇性降解(Protein & Cell 2019;Chemical Communications 2019);構(gòu)建FAK高效降解劑,抑制腫瘤的快速遷移(ACS Medicinal Chemistry Letters 2019)。此次研究也是該團(tuán)隊(duì)拓展新型靶向蛋白降解技術(shù)研究的進(jìn)一步延伸。
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清華大學(xué)博士生楊子默、博士后孫永匯為該工作共同第一作者,清華大學(xué)饒燏教授為通訊作者。該研究得到了清華大學(xué)吳畏教授、鄧海騰教授、李海濤教授、劉萬(wàn)里教授的大力幫助。該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金、國(guó)家重大科技專項(xiàng)“重大新藥開(kāi)發(fā)”和國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃的大力支持。
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41422-021-00533-6
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