通訊員李鑫
由我校生物科學與技術學院計算生物學中心、信息學院、以及美國三所大學研究人員發(fā)展的基因表達可塑性調(diào)控網(wǎng)絡的建模與計算研究取得原創(chuàng)性突破。
該模型以信息熵理論為基礎,對基因表達與環(huán)境互作的內(nèi)在機理進行聚類分析和依賴關系量化分析,能夠發(fā)現(xiàn)基因表達受環(huán)境影響的概貌、因果關系和量化細節(jié)。
這一成果近期在線發(fā)表在國際著名學術刊物 Nucleic Acids Research (最新影響因子8.026)上,首次以基因可塑性為變量進行互信息的計算和分析,發(fā)現(xiàn)了基因表達在基因組內(nèi)、基因組間、以及不同環(huán)境下的復雜的非線性調(diào)控依賴關系。
在我校計算生物學中心主任鄔榮領教授創(chuàng)立的北京林業(yè)大學-賓夕法尼亞州立大學合作研究平臺上,信息學院的王建新博士在中美兩地經(jīng)過一年半時間的潛心研究,終于攻克了信息熵理論與基因表達可塑性的融合建模這一世界性難題。這一工作的責任作者、計算生物學專家鄔榮領教授對王建新博士刻苦鉆研、敢于挑戰(zhàn)的精神極為贊賞, 認為這一工作為理解和研究生物與環(huán)境互作、進而為研究不同物種之間的互作和協(xié)同進化提供了新的有力工具。
參加該項工作的還有信息學院的碩士研究生陳波、美國賓夕法尼亞州立大學的博士研究生王亞群和王寧濤,美國休斯敦大學計算機系的Marc Garbey教授、美國佛羅里達大學醫(yī)學工程系的Roger Tran-Son-Tay教授和醫(yī)療系的Scott A. Berceli教授。這一研究是我校院際合作的典范, 更是我校計算生物學中心主導的多領域、跨學科國際合作的成果之一, 有力提高了我校在計算生物學領域的國際影響力。
論文鏈接:http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/03/06/nar.gkt147.full.pdf+html
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