黃黎珍副教授課題組開(kāi)發(fā)新冠突變株可視化快速檢測(cè)技術(shù)
隨著新冠病毒在全球持續(xù)蔓延，大量突變毒株不斷涌現(xiàn)，突變毒株免疫逃逸的發(fā)生及傳播力感染力的增強(qiáng)給疫情防控帶來(lái)更加嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。突變毒株的快速精準(zhǔn)檢測(cè)將大力推動(dòng)新冠突變流行高效預(yù)警監(jiān)測(cè)及新冠精準(zhǔn)防控。
目前病毒變異株檢測(cè)主要依賴于核酸測(cè)序，不僅耗時(shí)長(zhǎng)且成本高昂。CRISPR系統(tǒng)的單堿基識(shí)別特性使其成為突變檢測(cè)新型利器。華南理工大學(xué)黃黎珍副教授課題組與杜紅麗教授課題組在團(tuán)隊(duì)Cas12介導(dǎo)CORDS檢測(cè)系統(tǒng)及突變大數(shù)據(jù)自動(dòng)分析平臺(tái)之上，聯(lián)合廣東省疾病預(yù)防控制中心、南方醫(yī)科大學(xué)、中山大學(xué)等單位進(jìn)一步開(kāi)發(fā)新冠變異株檢測(cè)方法RT-CORDS，可快速、準(zhǔn)確檢測(cè)N501Y、D614G以及Δ69/70的變異株（圖1）。該檢測(cè)方法操作簡(jiǎn)便，可快速實(shí)現(xiàn)多種突變同步精準(zhǔn)檢測(cè)（單堿基突變、小片段缺失等）。相關(guān)成果發(fā)表在檢測(cè)領(lǐng)域國(guó)際權(quán)威期刊Biosensors and Bioelectronics（影響因子10.61）。
圖一.?RT-CORDS新冠變異株檢測(cè)平臺(tái)
RT-CORDS通過(guò)設(shè)計(jì)針對(duì)突變株和非突變株特異性Cas12a/crRNA-M及Cas12a/crRNA-M，采用熒光報(bào)告系統(tǒng)，40分鐘可檢測(cè)D614G突變株，N501Y及69/70 del變異株檢測(cè)時(shí)間僅需10分鐘；檢測(cè)靈敏度達(dá)6 copies/μL（圖二）。
圖二.?RT-CORDS熒光檢測(cè)平臺(tái)檢測(cè)N501Y、D614G和69/70deletion變異株
為了進(jìn)一步簡(jiǎn)便操作流程，課題組同時(shí)開(kāi)發(fā)RT-CORDS試紙條突變檢測(cè)系統(tǒng)，肉眼可視化直接讀取檢測(cè)變異株和非變異株。18例不同突變毒株的檢測(cè)結(jié)果表明，試紙條突變檢測(cè)結(jié)果與測(cè)序結(jié)果完全一致（準(zhǔn)確度100%）（圖三）。
圖三.?RT-CORDS試紙條平臺(tái)檢測(cè)SARS-CoV-2變異株
該項(xiàng)成果于2022年2月15日發(fā)表在檢測(cè)領(lǐng)域國(guó)際權(quán)威期刊Biosensors and Bioelectronics（影響因子10.61），黃黎珍副教授為通訊作者，碩士研究生何昌生為第一作者，華南理工大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院為第一單位，廣東省疾病預(yù)防控制中心為第二單位。
該項(xiàng)工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2018YFC0910201)、國(guó)家自然科學(xué)基金(31871292)和廣東省自然科學(xué)基金(2019A1515010619)等項(xiàng)目資助。
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https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0956566321008940?via%3Dihub
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