我院嚴(yán)威課題組利用DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)建立胸腺瘤分子分型新依據(jù)
?????? 胸腺上皮細(xì)胞腫瘤（Thymic epithelial tumors, TETs）包括胸腺瘤（Thymoma）和胸腺癌(Thymic carcinoma ,TC)。胸腺腫瘤的病源機(jī)制尚不清晰且瘤體性質(zhì)十分復(fù)雜，存在多個(gè)亞型且其分子病理學(xué)基礎(chǔ)尚未明確，在臨床病理診斷上一直存在較大的困難。由于胸腺是機(jī)體重要的免疫器官, T細(xì)胞分化、發(fā)育、成熟的場所，因此胸腺瘤的發(fā)生愈來愈被特殊關(guān)注。胸腺腫瘤的分型方法多樣，依據(jù)WHO胸腺腫瘤組織學(xué)分型標(biāo)準(zhǔn)可將TETs分為A型、AB型、B1型、B2型、B3型以及TC。
?????? 2020年1月22日，F(xiàn)EBS出版社旗下權(quán)威學(xué)術(shù)期刊Molecular Oncology ( IF: 5.962 ) 在線發(fā)表了上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院嚴(yán)威課題組與上海交通大學(xué)附屬胸科醫(yī)院合作的最新研究成果《Deciphering tissue-based proteome signatures revealed novel subtyping and prognostic markers for thymic epithelial tumors》，該研究利用DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)，對(duì)臨床上124例胸腺腫瘤組織樣本，基本囊括所有的腫瘤亞型（A, AB, B1, B2, B3, TSCC），配對(duì)10例健康胸腺組織進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。通過對(duì)90例樣本的初篩建立分子分型依據(jù)，隨后利用靶向蛋白質(zhì)組學(xué)PRM以及免疫組化和免疫熒光技術(shù)對(duì)44例樣本進(jìn)行驗(yàn)證。該研究鑒定并驗(yàn)證得到兩個(gè)具有分子分型和診斷價(jià)值的生物標(biāo)志物（CNOT2/9，SHMT1 ），有助于提高當(dāng)前臨床對(duì)胸腺瘤不同亞型的診斷及分型的準(zhǔn)確性。
?????? 研究新發(fā)現(xiàn)的兩個(gè)生物標(biāo)志物CNOT2、SHMT1, 對(duì)不同亞型的胸腺腫瘤展現(xiàn)出了很好的區(qū)分能力, 在MS和IHC上均得到成功驗(yàn)證。
?????? 本研究的第一作者為上海交大系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院助理研究員庫鑫和上海交大附屬胸科醫(yī)院的孫強(qiáng)玲；本文通訊作者為上海交大系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院嚴(yán)威研究員與上海交大附屬胸科醫(yī)院方文濤教授。
?????? 本研究得到了國家自然科學(xué)基金委以及上海交通大學(xué)醫(yī)工交叉等基金的資助。
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原文鏈接：https://doi.org/10.1002/1878-0261.12642
稿件來源：嚴(yán)威課題組 華瑩
圖文編輯：王華瑤
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