上海交通大學系統(tǒng)生物醫(yī)學研究院呂海濤課題組受邀發(fā)表“細胞代謝與代謝組學”未來發(fā)展策略重點評述文章
?????? 2019年11月月5日.?著名雜志Mass Spectrometry Reviews?（2018影響因子為9.068）為紀念主編 Dominic M. Desiderio教授卓越貢獻Proteomics, Mass Spectrometry, Neurobiology 等領域30年，推出2019 Honorable Issue，特邀上海交通大學呂海濤研究員結合課題組近年來的代謝組學實踐研究和未來創(chuàng)新規(guī)劃，起草題為：“FUNCTIONAL METABOLOMICS DECIPHER BIOCHEMICAL FUNCTIONS AND ASSOCIATED MECHANISMS UNDERLIE SMALL-MOLECULE METABOLISM”的細胞代謝與代謝組學專題戰(zhàn)略評述文章 (Critical Review)，重點評述過去10年代謝組學在細胞代謝關鍵科學問題解決方面的研究進展，并梳理其局限不足、提出未來發(fā)展方向和全新解決方案。文章重點定義并提出表型代謝組學(Phenotypic Metabolomics)，聚焦其與功能代謝組學(Functional Metabolomics)的共性優(yōu)勢和局限，未來代謝與代謝組學研究應該走向功能代謝組學支撐的代謝修飾與功能調控研究，多組學/生物化學前沿策略的的系統(tǒng)介入聯(lián)姻，將是必由之路。?
?????? 上海交通大學系統(tǒng)生物醫(yī)學研究院呂海濤研究員為論文通訊作者，上海交通大學為唯一通訊單位，2018級博士生胡龍龍、2018級碩士生劉京凈、2018級聯(lián)合培養(yǎng)碩士生張文華和2019級碩士生王天宇為論文共同第一作者，黑龍江中醫(yī)藥大學張寧教授和新加坡國立大學Lee Yie Hou教授為共同作者。論文相關主題工作得到國家重點研發(fā)計劃課題、國家自然科學基金面上項目、上海交通大學高層次人才啟動基金和中央高校基本科研業(yè)務費重大創(chuàng)新專項的資金支持。
??????本文主要內容如下：小分子代謝／Small-Molecule Metabolism 提供所有生命體細胞（人、動物、植物和微生物等）生長、增值、分化和功能化所必須的營養(yǎng)物質(Nutrients)，能量 (Energy Charges)和微環(huán)境（Biochemical Environments）。代謝組學／Metabolomics 作為后基因時代，系統(tǒng)生物學驅動的新生代組學技術，其核心價值是通過定性描述和定量表征不同生物基質中小分子代謝組以闡明與細胞代謝相關的所有關鍵科學問題。進而，我們可以從代謝維度認識不同的生物化學過程和生物學事件，如疾病的發(fā)生/診斷、藥物作用/毒理、營養(yǎng)健康/干預、植物生理/病理、微生物感染/治療，環(huán)境毒理/修復，基因突變/修飾等。然而，過去的十年，代謝組學的發(fā)展，同其它生命組學(Life-Omics)一樣，面臨一個巨大困局。由于我們現(xiàn)有技術手段和生物化學認知的局限性，當下，組學研究仍處于表型數(shù)據(jù)的高通量采集與初步分析水平，即我們定義為表型代謝組學研究?(Phenotypic Metabolomics)，若要尋求真正解決上述與代謝相關的關鍵科學問題，功能代謝組學研究(Functional Metabolomics)，勢在必行。
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原文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/mas.21611
稿件來源：呂海濤課題組
圖文編輯：王華瑤
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