實驗室開發(fā)了一種新的基于內(nèi)共生學說的代謝網(wǎng)絡空缺填補的方法（DEF），用于高精度的代謝網(wǎng)絡空缺填補。通過系統(tǒng)生物學的方法和實驗手段對網(wǎng)絡進行精細的修正和評估，包括化合物胞內(nèi)價態(tài)的計算，反應方程式的配平，反應可逆性的預測，空缺的查找及填補。該成果以“DEF: An automated dead-end filling approach based on quasi-endosymbiosis”為題發(fā)表在《Bioinformatics》（IF=5.766）。該論文第一作者為劉麗麗博士，第二、第三作者張子鈞、盛濤濤均為我院本科生。
近期陳銘教授實驗室圍繞植物非編碼RNA也在線發(fā)表了若干論文。
1. Chunhui Yuan, Xianwen Meng, Xue Li, Nicola Illing, Robert Ingle, Jingjing Wang, Ming Chen* (2016) PceRBase: A database of plant competing endogenous RNA. Nucleic Acids Research, DOI: 10.1093/nar/gkw916. (IF=9.202)
2. Xianwen Meng, Xue Li, Peijing Zhang, Jingjing Wang, Yincong Zhou, Ming Chen* (2016) Circular RNA: an emerging key player in RNA world. Briefings in Bioinformatics, DOI: 10.1093/bib/bbw045. (IF=8.399)
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