?近日,RNA領域權威期刊RNA以“The S. pombe mitochondrial transcriptome”為題在線發(fā)表了的生命科學學院黃鷹教授課題組關于裂殖酵母線粒體轉錄組的最新研究進展。RNA雜志由冷泉港出版社出版發(fā)行,是RNA領域的經典旗艦期刊。
?線粒體是真核生物生產能量的細胞器,通過氧化磷酸化合成ATP。此外,線粒體參與許多重要的細胞過程,包括氨基酸和脂肪酸合成,活性氧物質產生,細胞凋亡和衰老。線粒體功能障礙與許多重要疾病相關,其中包括癌癥,神經退行性疾病,線粒體遺傳性疾病以及和代謝紊亂疾病如糖尿病有關。粟酒裂殖酵母作為一種簡單的真核模式生物,其與哺乳動物細胞的呼吸生理及線粒體基因組組成方面都極具相似性。因此粟酒裂殖酵母是一個很有潛力的線粒體研究模型。?
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該論文主要分析了裂殖酵母線粒體基因表達以及轉錄后過程控制,包括線粒體RNA(mt-RNA)加工,修飾,衰變和質量控制。缺陷的線粒體基因表達導致線粒體氧化磷酸化缺乏并且已經涉及多種人類疾病。為了完全了解線粒體轉錄和RNA加工,我們對來自裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)的mt-RNA進行了RNA-seq分析。RNA-seq分析表明,mt-RNA的豐度差異很大。數據分析還揭示了mt-RNA精確加工位點,包括線粒體tRNA(mt-tRNA)5'-末端加工酶RNase P的非典型的RNA切割。此外,該論文研究揭示了先前未知的線粒體轉錄物,包括tRNA 5'-末端加工酶RNase P RNA成分衍生的片段;線粒體小RNA(mitosRNA),例如mt-tRNA衍生的片段(mt-tRF)和mt-tRNA半分子;以及在粟酒裂殖酵母中用3'-CCACCA / CCACC標記的mt-tRNA。最后,RNA-seq揭示了編碼粟酒裂殖酵母線粒體tRNA 3'末端加工酶的trz2失活導致mt-tRNA 3'末端加工全局性損害;抑制mt-mRNA 5'-末端加工并導致未加工轉錄產物的積累;證明使用RNA-seq檢測已知或預測參與粟酒裂殖酵母中mt-RNA加工的蛋白質的可行性。我們的工作揭示了真菌線粒體轉錄組的復雜性,并為使用S. pombe作為線粒體研究模型提供了框架。
相關研究發(fā)表在RNA學領域權威雜志RNA上(文章鏈接:http://rnajournal.cshlp.org/content/early/2018/06/28/rna.064477.117.abst...),商巾杰副教授為第一作者,黃鷹教授為通訊作者,相關研究受到國家自然科學基金、江蘇省優(yōu)勢學科建設項目等的支持。
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