能量耦合因子(ECF)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是一類非常新穎的蛋白,這類蛋白質(zhì)的功能主要是細(xì)菌對(duì)物質(zhì)的吸收,包括維生素、微量金屬元素、氨基酸等。由于細(xì)菌自身缺乏合成這些微量物質(zhì)的能力,ECF轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白成了這些細(xì)菌賴以生存的關(guān)鍵,也有可能成為開(kāi)發(fā)抗生素藥物的新靶標(biāo)。
圖. (左) 能量耦合因子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白HmpT的晶體結(jié)構(gòu)圖,包括A,A’,T和S組份。(右)分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算機(jī)模擬揭示能量耦合因子轉(zhuǎn)運(yùn)吡哆胺的最新機(jī)理
HmpT是能量耦合因子家族的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白之一。清華大學(xué)化學(xué)系基礎(chǔ)分子中心的尹航教授研究課題組與生命科學(xué)學(xué)院施一公院士課題組合作,通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算機(jī)模擬和高分辨質(zhì)譜分析等實(shí)驗(yàn)方法,首次確定維生素B6的前體化合物吡哆胺為HmpT的轉(zhuǎn)用底物。該研究工作于7月14日作為Featured Article發(fā)表在了 《自然》出版集團(tuán)的最新刊物《細(xì)胞?發(fā)現(xiàn)》上,標(biāo)題為《吡哆胺是能量耦合因子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白HmpT的酶促底物》(Pyridoxamine is a substrate of the energy-coupling factor transporter HmpT),參見(jiàn) Cell Discovery 2015, 1, 15014 (http://www.nature.com/articles/celldisc201514). 本研究的成果為理解維生素B6在HmpT的轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程中的作用機(jī)制具有重要的理論意義;也為新一代抗生素藥物的開(kāi)發(fā)提供了科學(xué)的指導(dǎo)意義。項(xiàng)目得到了科技部和國(guó)家自然科學(xué)基金的支持
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