錢峰課題組與倪挺課題組合作揭示內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒對固有免疫調(diào)控的新機制
2019年7月30日，我院錢峰課題組與倪挺課題組合作研究，于美國微生物學(xué)會期刊《mBio》發(fā)表了題為“Endogenous Retrovirus-Derived Long Noncoding RNA Enhances Innate Immune Responses via Derepressing RELA Expression”的研究論文，揭示了內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒對固有免疫調(diào)控的新機制。
內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒（Endogenous retroviruses，ERVs）是基因組轉(zhuǎn)座子元件之一，并廣泛存在于多種有鄂脊椎動物的基因組中。ERV約占了人類基因組的5% - 8%。一直以來，ERV都被認為是“自私的基因”，能夠自我復(fù)制，并且可導(dǎo)致宿主基因組不穩(wěn)定。但是近年來越來越多的研究發(fā)現(xiàn)，ERV可能以某種順式或反式作用方式在宿主體內(nèi)發(fā)揮重要作用。ERV是否也參與了宿主抗病毒免疫應(yīng)答，這方面的研究目前鮮有報道。
研究團隊通過RNA-seq方法發(fā)現(xiàn)了小鼠基因組中存在大量轉(zhuǎn)錄的ERV元件，并且在免疫應(yīng)答中ERV元件比常規(guī)長鏈非編碼RNA具有更大的變化幅度。本研究發(fā)現(xiàn)并鑒定了一個內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒來源的長鏈非編碼RNA (Lnc-EPAV, ERV-derived lncRNA positively regulates antiviral responses)。作者在細胞和基因編輯小鼠層面研究發(fā)現(xiàn)，lnc-EPAV能夠結(jié)合細胞核內(nèi)的多功能蛋白SFPQ，并且通過SFPQ在轉(zhuǎn)錄水平提高免疫關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子RELA的轉(zhuǎn)錄，進而提高宿主抗病毒免疫應(yīng)答的能力。課題組進一步研究發(fā)現(xiàn)人細胞中同樣存在大量人內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒（HERV）來源的轉(zhuǎn)錄本，提示了內(nèi)源逆轉(zhuǎn)錄病毒在調(diào)控免疫應(yīng)答方面的保守性。這一研究揭示了內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒在進化過程中可轉(zhuǎn)變?yōu)閷λ拗饔欣拿庖哒{(diào)控元件，為理解固有免疫的調(diào)控機制提供了新思路。
圖：lnc-EPAV增強宿主抗病毒天然免疫應(yīng)答的作用模式圖
青年研究員錢峰和倪挺研究員共同指導(dǎo)的博士研究生周斌為本文的第一作者，研究員錢峰和倪挺研究員為本文的共同通訊作者。該研究獲得國家自然科學(xué)基金委和國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃的支持。
文章全文鏈接：https://mbio.asm.org/content/10/4/e00937-19
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