2014年1月22日,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《Proteomics》在線發(fā)表了韓家淮教授課題組的研究論文“Quantitative Phosphoproteomic Analysis of RIP3-dependent Protein Phosphorylation in the Course of TNF-induced Necroptosis”。
??? TNF誘導(dǎo)鼠源L929細(xì)胞死亡是研究細(xì)胞壞死(necrosis,又稱為necroptosis)的良好模型。近期研究表明,RIP3蛋白激酶在此過(guò)程中起著重要作用,但是RIP3的磷酸化底物卻知之甚少。在這篇研究中,我們首先用TNF去刺激野生型L929細(xì)胞和RIP3敲低L929細(xì)胞0.5小時(shí)、2小時(shí)和4小時(shí),分別收集這兩株細(xì)胞,然后利用定量磷酸化蛋白組技術(shù)去比較這兩種細(xì)胞中磷酸化水平的不同。我們一共鑒定到了2,762個(gè)蛋白上的8,058個(gè)磷酸化肽段,對(duì)應(yīng)6,892個(gè)磷酸化位點(diǎn)。通過(guò)比較這些磷酸化位點(diǎn)在這兩株細(xì)胞中的差異,我們發(fā)現(xiàn)在TNF刺激0.5、2和4小時(shí)之后,分別有174,167和177個(gè)磷酸化位點(diǎn)變化。值得注意的是,其中大部分的磷酸化位點(diǎn)并沒(méi)有在我們上次的研究中被鑒定到,說(shuō)明本研究中獲得的數(shù)據(jù)對(duì)TNF誘導(dǎo)的L929細(xì)胞壞死研究有較大的啟示。
該文章的第一作者為博士后鐘傳奇,博士研究生李淵越。
論文原文:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24453211
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(文/張芳林)
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