N端氨基：N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時，通常將N端放在肽鏈的左邊。

L-賴氨酸：lysine。系統(tǒng)命名為(2S)-6-二氨基已酸。是編碼氨基酸中的堿性氨基酸，哺乳動物的必需氨基酸。在蛋白質中的賴氨酸可以被修飾為多種形式的衍生物。符號：K，Lys。

L-亮氨酸：leucine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：L，Leu。

L-纈氨酸：valine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：V，Val。在某些放線菌素如纈霉素中存在 D-纈氨酸。

L-苯丙氨酸：phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：F，Phe。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

甘氨酸：glycine。系統(tǒng)命名為 2-氨基乙酸。是編碼氨基酸中沒有旋光性的最簡單的氨基酸，因具有甜味而得名。符號：G，Gly。

D型絲氨酸

D型絲氨酸

L-亮氨酸：leucine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：L，Leu。

L-賴氨酸：lysine。系統(tǒng)命名為(2S)-6-二氨基已酸。是編碼氨基酸中的堿性氨基酸，哺乳動物的必需氨基酸。在蛋白質中的賴氨酸可以被修飾為多種形式的衍生物。符號：K，Lys。

L-蘇氨酸：threonine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-(3R)-羥基丁酸。有兩個手性中心，是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：T，Thr。

L-甲硫氨酸：methionine又稱“蛋氨酸”。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲硫基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：M，Met。

天冬酰胺：asparagine。L-天冬酰胺的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-氨?；?，是編碼氨基酸。符號：N，Asn。D-天冬酰胺存在于短桿菌肽A分子中。

L-谷氨酰胺：glutamine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-氨?；∷?，是編碼氨基酸。符號：GIn，Q。

天冬酰胺：asparagine。L-天冬酰胺的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-氨?；?，是編碼氨基酸。符號：N，Asn。D-天冬酰胺存在于短桿菌肽A分子中。

L-絲氨酸：serine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-羥基丙酸。是編碼氨基酸。因可從蠶絲中獲得而得名。符號：S，Ser。在絲原蛋白及某些抗菌素中含有 D-絲氨酸。

L-色氨酸：tryptophan[e]。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-(3-吲哚基)丙酸。是編碼氨基酸，哺乳動物的必需氨基酸。符號：W，Trp。某些抗菌素中含有 D-色氨酸。

L-谷氨酰胺：glutamine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-氨?；∷幔蔷幋a氨基酸。符號：GIn，Q。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理條件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號：R，Arg。

天冬酰胺：asparagine。L-天冬酰胺的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-氨?；幔蔷幋a氨基酸。符號：N，Asn。D-天冬酰胺存在于短桿菌肽A分子中。

L-谷氨酸：glutamic acid。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-戊二酸。是編碼氨基酸。符號：E，Glu。D-谷氨酸存在于多種細菌的細胞壁和某些細菌桿菌肽中。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

L-亮氨酸：leucine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：L，Leu。

L-谷氨酰胺：glutamine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-氨?；∷幔蔷幋a氨基酸。符號：GIn，Q。

L-苯丙氨酸：phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：F，Phe。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理條件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號：R，Arg。

天冬酰胺：asparagine。L-天冬酰胺的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-氨?；幔蔷幋a氨基酸。符號：N，Asn。D-天冬酰胺存在于短桿菌肽A分子中。

L-谷氨酸：glutamic acid。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-戊二酸。是編碼氨基酸。符號：E，Glu。D-谷氨酸存在于多種細菌的細胞壁和某些細菌桿菌肽中。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

L-谷氨酸：glutamic acid。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-戊二酸。是編碼氨基酸。符號：E，Glu。D-谷氨酸存在于多種細菌的細胞壁和某些細菌桿菌肽中。

L-蘇氨酸：threonine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-(3R)-羥基丁酸。有兩個手性中心，是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：T，Thr。

L-苯丙氨酸：phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號：F，Phe。

L-精氨酸：arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理條件下帶正電荷，為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號：R，Arg。

天冬酰胺：asparagine。L-天冬酰胺的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-氨?；?，是編碼氨基酸。符號：N，Asn。D-天冬酰胺存在于短桿菌肽A分子中。

L-谷氨酰胺：glutamine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-氨酰基丁酸，是編碼氨基酸。符號：GIn，Q。

丙氨酸：alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸，是編碼氨基酸，也叫L-α-丙氨酸。符號：A，Ala。D-丙氨酸存在于多種細菌細胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

C端羧基：C-terminal carboxyl group。在肽或多肽鏈中含有游離羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時，通常將C端放在肽鏈的右邊。