我們的研究旨在了解蛋白質(zhì)和多肽的生物分子相互作用通過肽化學(xué)介導(dǎo)生物學(xué)和疾病相關(guān)的過程，并開發(fā)新的分子和工具來控制或可視化這些過程。 我們特別有興趣理解介導(dǎo)淀粉樣蛋白錯誤折疊和相關(guān)細(xì)胞變性的蛋白質(zhì)相互作用，以及設(shè)計基于肽的分子和化學(xué)方法來抑制這些過程。我們還有興趣表征動脈粥樣硬化中的促炎性趨化因子相互作用，并設(shè)計肽來調(diào)節(jié)這些相互作用并控制它們的作用。我們正在使用蛋白質(zhì)（肽）化學(xué)設(shè)計和合成策略以及廣泛的生化和生物物理方法。

Fisk Lab 的基于熒光的有義密碼子重新分配屏幕。我們的篩選評估了反密碼子修飾的 tRNA 結(jié)合酪氨酸 (Tyr) 以響應(yīng)在標(biāo)準(zhǔn)大腸桿菌遺傳密碼中分配了另一個身份的有義密碼子的能力。超級文件夾 GFP 的殘基 65-67 指定了自動化折疊成三肽熒光團(tuán)的 Thr-Tyr-Gly 序列。用任何其他天然氨基酸替換第 66 位的 Tyr 可有效消除蛋白質(zhì)的熒光。(生物化學(xué), 2015, 54 (50), pp 7355–7364)

我們的研究重點是膜蛋白的結(jié)構(gòu)表征和從頭蛋白質(zhì)設(shè)計，以了解與人類疾病相關(guān)的生物過程并開發(fā)新的治療方法。 蛋白質(zhì)設(shè)計：我們使用從頭蛋白質(zhì)設(shè)計來測試我們的知識是否已經(jīng)足夠先進(jìn)，可以根據(jù)第一原理生成結(jié)構(gòu)和功能。我們的實驗室還使用這種方法將所需的功能整合到生物系統(tǒng)中。 整合素抑制劑：我們研究整合素中信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和構(gòu)象變化的機(jī)制，并設(shè)計了特定整合素的新型小分子抑制劑，用作組織纖維化和其他疾病的治療劑。 流感：我們研究甲型流感的基質(zhì) 2 蛋白 (M2)，它是在流感病毒包膜中發(fā)現(xiàn)的藥物靶標(biāo)。 阿爾茨海默?。何覀儗Y(jié)構(gòu)表征和破壞與阿爾茨海默病相關(guān)的 Aβ 積累感興趣。 細(xì)菌感知：我們對細(xì)菌感知環(huán)境和適應(yīng)不同環(huán)境壓力的機(jī)制感興趣。 計算工具：我們采用了一種受自然啟發(fā)的蛋白質(zhì)設(shè)計方法。

CCMS 開創(chuàng)的光譜網(wǎng)絡(luò)范式在三個基本方面不同于解釋串聯(lián)質(zhì)譜的主流范式。首先，光譜網(wǎng)絡(luò)基于將光譜與其他光譜而不是與蛋白質(zhì)序列進(jìn)行匹配。其次，光譜網(wǎng)絡(luò)甚至在考慮可能的識別之前就從相關(guān)肽（例如，修飾/未修飾或重疊序列變體）中找到光譜。第三，光譜網(wǎng)絡(luò)確定來自相關(guān)肽的光譜組的一致識別，而不是單獨嘗試一次識別每個光譜。

滲透性分析開發(fā) 大多數(shù)膜通透性測定是在基于細(xì)胞的系統(tǒng)（如 CACO-2）或非膜無細(xì)胞系統(tǒng)（如 PAMPA）中進(jìn)行的。我們正在開發(fā)一種基于脂質(zhì)體的滲透性系統(tǒng)，旨在反映生理上準(zhǔn)確的磷脂雙層中的被動滲透性。 固相合成方法 我們正在開發(fā)構(gòu)建環(huán)狀肽的新方法，其靈感來自于天然產(chǎn)物，例如環(huán)孢菌素 A、destruxins 和 aureobasidin E。這些環(huán)狀肽中的許多都包含主鏈修飾，例如 N-甲基化和內(nèi)酯 (depsi) 鍵，用于增加它們的結(jié)構(gòu)多樣性并增強(qiáng)膜通透性和代謝穩(wěn)定性。我們對新的合成方法感興趣，這些方法有助于合成含有這些非蛋白氨基酸和連接的環(huán)狀肽的天然產(chǎn)物樣文庫。 環(huán)肽文庫 我們正在使用面向多樣性的合成技術(shù)來生成受天然產(chǎn)物啟發(fā)的大型環(huán)狀肽庫。我們正在使用從模型系統(tǒng)研究中學(xué)到的原則，使圖書館成員偏向于膜通透性和代謝穩(wěn)定性。 抑制蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用